物生長的營養元素有17種之多，分為大量、中量和微量營養元素。其中大量元素包括碳、氫、氧、氮、磷、鉀。中量元素包括鈣、鎂、硫。微量元素包括鐵、銅、鋅、錳、鉬、硼、鎳和氯。隨著現代農業生產水平的提高，以及氮磷鉀三要素肥料的大量使用，土壤中微量元素缺乏亦呈日趨嚴重的趨勢。其作用歸納起來主要有：
一、提高作物產量  一些農田由于長期過量使用氮磷鉀等大量元素肥料，土質惡化，增產幅度已很有限。針對性地施用微肥，是提高中、低產田產量有效的技術措施，也是維持高產田連續增產的重要手段。通過增施中微肥，滿足了農作物對各營養元素的需求，使得農作物能夠正常地生長發育，從而獲得理想的產量和效益。
二、改善作物品質  中微量元素肥料的施用，大大改善了作物的無機營養平衡，不僅使農作物產量大幅度提高，而且使農產品品質大為改善，有效降低了農產品中亞硝酸鹽的含量，一些地方性缺素造成的疾病也可以得到有效預防和治療。微肥的科學施用，既滿足了農作物對營養元素的需求，使之正常發育，完全成熟，提高了農產品的質量，又減少了大量元素氮磷鉀的剩余，避免了肥料浪費，減少土壤污染。
三、提高化肥利用率  根據養分最小定律，補充中微量元素肥料，有利于平衡大、中、微量營養元素之間的比例，對作物吸收養分有良好的促進作用，而不再片面單施某一種元素肥料，造成浪費。
四、減輕作物病蟲害  由于微量元素肥料的施用，使農作物所需的各種元素得到平衡合理的供應，這就大大增強了作物的抗病、抗寒、抗高溫、抗干旱的能力，農作物因缺素造成的疾病不復存在，使農作物可以健康生長。如作物施硼以后，能促進糖在體內運轉正常而抗性加強，硼糖絡合物是酸性較強的絡合物，使細胞液反應偏酸而不利于病菌生長。
五、減少環境污染  增施中微量元素肥料，可使農作物按比例吸收所需的各種營養元素，有效提高肥料利用率，減少了因肥料流失產生的環境污染，對環境保護起到積極作用。
六、提高經濟效益  由于微量元素用量極“微”，可以用較微小的代價換取較大的經濟效益，投入產出比高達1∶50~1∶100，甚至更高，而大化肥的投入與產出比一般為1∶5~1∶10，甚至更低。
近幾年來，人們對農產品的要求逐漸從數量向品質轉化。因此，合理施用中微肥不僅可提高產量而且對提高農產品的品質效果非常明顯還能有效增強作物對病害、低溫、高溫和干旱的抗逆性。